自从日本开发出只要女性才能操纵的飞行超火器“IS”以后，世界产生了天翻地覆的转变，女性的职位被提升到优先准位。培养IS操纵者的学校“IS学院”每年接纳来自世界各地的优异候补生少女。然而，主人公织斑一夏虽是个男生却不知由于何缘由…