稻叶夕士（阿部敦配音）是方才考入了东条商校就读的一年级男生，由于童年时代的不幸遭遇，稻叶一向以来都寄宿在亲戚的家中，过着俯仰由人的生活。现在，考上了寄宿制的高中，稻叶对未来自由的生活布满了憧憬。稻叶搬进了名为寿庄的公寓里…

故事紧接第一作的结局剧情而睁开。在爆丸中，初代爆丸6战士在协力击败掌握沉寂核心的白色怪兽白龙以后，爆丸世界和人类世界恢复了和平。可是和平只是短暂的，在那不久以后的一天，因不测的时空扭曲出现了一个空间联结，从那里出现了一个…

世界观是由三种差别类型的卡片组合即可发生异空间，人物能够操作名为“爆丸”的怪兽进行战役，少年空操弹马操作着庞大爆丸DORAKO与朋友一路战役抢救世界。 某日，世界各地小朋友收到些神奇的卡，卡中会走出怪兽，小朋友以此作为格斗游戏…