简介：20世纪末，世界各地的天才少年构成了一个名为"炼金之星"的组织，其成员之一的高山我梦作为"XIG"的一员，靠大地给予的红光变身成盖亚·奥特曼后，投入了同CRISIS计算机所预测到的"根源性扑灭招来体"进行的誓死决战中；另一方面，已脱离"炼金之星"的"藤宫博也"坚定地认为：对于地球而言，人类才是真实的癌细胞。他凭着"蓝光"的能力，变身成与"盖亚"相对峙的"蓝色奥特曼--阿古茹·奥特曼"。作为日本平成年度奥特曼三作品的压轴戏，盖亚·奥特曼其最大的转变在于"盖亚和阿古茹"这二个敌对、且都为地球人诞生的"人类奥特曼"的退场。当然，他俩的战役排场也属前所未闻。同时，二人的对峙观点贯穿前半段，是以前半段贴近于连续剧。
