洪荒时期，黄帝(丁军 饰)、炎帝、蚩尤(韩东 饰)(韩东 饰)三大部落争夺全国。炎帝部落老首领之子炽因不满父亲将首领之位传于身世不明的炎而策动兵变。炎帝停息了兵变后，炽因着落不明。不久，炎帝被黄帝打败以后，隐姓埋名远走异乡。多年后炎帝假名为神农(焦恩俊 饰)，尝百草救世人。黄帝发明治病救人的神农原是炎帝，两个老敌手重逢，黄帝对神农既布满怨恨又非常敬重。尽管神农用尽了方法，也只能暂时控制瘟疫的蔓延，并不行够彻底的消除瘟疫。神农感怀世人疾苦，独自祈求上天，以期求得清除瘟疫之法。后逢神界大乱，朝不保夕之时，女娲(刘佳 饰)回归，降伏了魔帝。花神(文清 饰)挽劝母亲放过魔帝。女娲遂开辟了冥界供魔帝职掌。世人皆以为天上人世重归承平。不意女娲看见人世仍然是荒芜一片，纷乱四起，非常寒心，有了灭世的念头。玉帝(廖京生 饰)和黄帝联手与女娲一战，终不是女娲的敌手。
