在尼比鲁星球探查期间，企业号舰长柯克（克里斯·派恩Chris Pine 饰）为营救史波克（扎克瑞·昆图 Zachary Quinto 饰）采取了轻举妄动的行为，几近危及全舰队员的生命，他也为此支出价格。不久，柯克官回复复兴职，而伦敦产生一路死亡超…

柯克船长（克里斯·派恩 Chris Pine 饰）和企业号的船员们来到了银河系中未知的一个区域，起头实现他们5年的使命——探索新世界，寻觅新物种。却在途中滞留异星，遭遇了本地种族追杀，他们必须找到方法离开这个星球。