故事产生在遥远的未来，肆虐的异生兽给人类的平安带来了庞大的困扰，为了抵抗异兽的进攻，日本政府成立了防卫组织TLT，此中，夜袭队拥有着最壮大的实力和最微弱的武器，是整个组织内部的中坚气力。　　然而，面对经过了进化的新型异生兽…

雷等人在收到求救旌旗灯号后立即前去救援，但却被吸进扭曲空间。在扭曲空间的一颗惑星上，出现了一头机械哥莫拉。原来是莎乐美星人正在进行秘密试验，令所有次元的联系都集结在一路。合法危机之际，赛罗奥特曼出现了！

本来海不扬波的东京湾，突然有大批水蒸气喷涌而出，与此同时位于东京湾海面下方的海底隧道产生坍塌变乱。为了查明一系列异常现象和重大变乱的缘由，当局方面迅速召开紧急会议。通过网络上的一些现场视频，内阁官房副长官矢口兰堂（长谷川…