年幼的爱力克兄弟非常忖量归天的母亲，不吝触犯炼金术中最大的禁忌，进行了人体炼成。可是炼成失败了，哥哥爱德华落空了左腿与右臂，弟弟阿尔冯斯落空了肉体，只能把灵魂附身在一副铠甲上。为了了偿他们自己的罪，找回落空的一切，兄弟二…

知名製藥公司-泰達羅斯（Daidalos）的總部發生了一場爆炸案，一個少年被困在崩落的鋼架中無法脫身，性命危在夙夜迟早。此時，在以不追究無照醫療行為的條件下，黑傑克進行了一場任誰都無法想像的「外科手術」…统一災難引發了另一場悲劇…

新手训练家小智从大木博士那里获得的是一只勉委曲强又喜怒无常又不喜好进入神奇瑰宝球的皮卡丘，小智离开故乡真新镇，在关都处所睁开他的旅程。在赢得皮卡丘的信赖后，小智认真地开展他的旅程来挑战各地的道馆，加入神奇瑰宝联盟。在旅途…