香港某地出现爆炸案件，前拆弹专家潘乘风因晕厥于现场，他意外陷于爆炸案件，清醒后的潘乘风就只能一面出逃一面查明真相，他被同是拆弹专家、好朋友兼同事的董卓文抓捕，但与此同时又被反恐特勤队督察，同时也是潘乘风的前任女友庞玲保护，三个人的关系非常千头万绪，他们两个人给潘乘风描述了两段截然不同的经历。有规划的爆炸案件接连不断出现，事实真相却越来越扑朔迷离。潘乘风在执行任务时失去了一条腿，对拆弹工作造成了职业冲击。尽管潘乘风自我调侃为“最有型的拆弹专家”，但同为拆弹专家的董卓文对他“之前的阿风，为了能救人命都不要”的评价里，也不由自主令人猜想潘乘风这一个角色的复杂性及变化。
《拆弹专家2》描述的故事主题比较新奇，和之前港片的风格纷歧样，这一次没有带“男主光环”的能量，反而是用非常真实的故事来描述。相较于那些整个影片全是吹男主盛世美颜和演技的，这部影片则是令人着迷，亲临其境般的感受那种氛围。无可置疑的是《拆弹专家2》反派肯定有男主的一份，但他则用实际行动表示自己的觉悟，只是太迟了，悲剧还是发生了很多。
