产科医生郭靖，喜爱对任何工作进行研究、推测、分析、判断，并将此用在临床第一线。这个被领导看做“游手好闲”的边缘医生居然要追求医院里最年轻、最漂亮的获得国家政府津贴的主任黄蓉，郭靖的领导产科主任黄彩云恰好是黄蓉的姐姐，她绝差别意妹妹嫁给这样的人，因此处处设难题，层层设阻碍。身为小大夫的郭靖从工作和生活的微小之处，察觉黄蓉的困扰，最终通过不懈的努力和悉心引导和用心的呵护，最后和黄蓉过上幸福的生活。
就像该剧片名一样，“小大夫”郭靖并没有扎进“疑难杂症”的治疗中，而是从日常生活中的观察人心，感受冷暖。以医院为窗口，以主人公视角为承载，反应出社会百态，将伴侣关系、人际沟通、情感模式、感情悲剧等逐一展现，欢乐之余留有考虑余地。本剧从产科医生郭靖的角度展现了一个小大夫的琐碎生活，于此同时也展现了一个个在医疗事务背后温暖人心的故事。
